コシヒカリ：先祖はまずいコメ　粘りの源のＤＮＡ解析 - 毎日ｊｐ(毎日新聞)

コシヒカリは１９５６年、試験場で開発された。作付面積は７９年から２９年間、連続日本一で、２～１０位もコシヒカリの子孫が占める。試験場は優れた食味の秘密を探るため、開発に利用された４２品種を対象に、粘りや軟らかさのもととなる第２染色体上のＤＮＡを解析した。
　
その結果、コシヒカリ型のＤＮＡを持っていたのは、コシヒカリの親の「農林１号」、祖父の「陸羽１３２号」、さらにその祖先の「愛国」と分かった。おいしさの祖先と信じられていた「亀の尾」（山形県）や「朝日」（岡山県）に、コシヒカリ型ＤＮＡはほとんど含まれていなかった。硬さなど他の要素は今後調べるという。
　
解析した小林麻子研究員（育種学）は「コシヒカリがおいしいのは、においや硬さなどさまざまな要素のバランスが良いからだ。愛国も一役買っていたことを踏まえ、新品種の開発に役立てたい」と話す。

特性の良い品種を掛け合わせたからといって、もっと良い品種ができるわけじゃない。　というのが品種改良の面白いところですね。
遺伝子レベルの解析ができるようになっても、まだまだ判っていない事は多いです。