5.2からPSGI対応になったMTですが、プラグインはPSGI対応になっていない場合があります。
そういうときはプラグインが入っているディレクトリだけPSGIの対象から外してあげるとよいです。
httpd.confで、下記のように指定します。
ProxyPass /cgi-bin/MT6/plugins/ !
ProxyPassReverse /cgi-bin/MT6/plugins/ !
ProxyPass /cgi-bin/MT6/ http://localhost:5000/cgi-bin/MT6/
ProxyPassReverse /cgi-bin/MT6/ http://localhost:5000/cgi-bin/MT6/
上記設定だとプラグイン全体がリバースプロキシの対象から外れます(すなわちCGI環境で動く)。
ちなみにMTの管理画面にSSLでアクセスしている場合は、httpd-ssl.conf に
<VirtualHost _default_:443>
(中略)
SSLProxyEngine on
ProxyPass /cgi-bin/MT6/ https://localhost:5000/cgi-bin/MT6/
ProxyPassReverse /cgi-bin/MT6/ https://localhost:5000/cgi-bin/MT6/
という記述も必要です。