上がSA-98Eです。
少し奥行きが長いのかな？と思ってましたが、外寸は全く同じですね。 フロントパネルのレター以外に差異はありません。
背面も一緒。
ACアダプタも一緒です。
で、テレビに付け替えて聴いてみましたが、音も一緒です。 全く変わりません。 出力が倍になっても、ボリュームの位置は「9時ちょっと前」でほぼ一緒です。
半年以上使ってエージングが進んだSA-98「無印」と差異がないというのは、ある意味「E」の素性の良さを表しているのかもしれません。
新規で購入する場合に、あえて「無印」を選ぶ必要はないと思いますが、「無印」を持っている人が「E」に買い替える必要は全くありません。