以前に、ものすごくWebサーバーが重くなることがあって、MTCloseCommentsで古いエントリーのコメント欄を閉じたら改善されたことがありました。
あれも一種のDOS攻撃だったようです。
Apacheに対するDOS攻撃からサーバーを守るには、mod_evasiveというモジュールが有効だということです。
「ひるねこ日記」さんの記事を参考に導入してみました。 FreeBSDの場合は、/usr/ports/www/mod_evasive20 から導入します。
最近は被害を受けていないのですが、まあ保険を兼ねてということで。