同系のエンジンを積むWave110iのパーツリストも手元にあったのですが、今まであまり興味がわかなくてちゃんと確認していませんでした。

まずWave125のクランクケースとの違いです。

半透明に薄くなっているのがWave125です。　カウンターシャフトを基準にして重ねてみると、３本のマウントボルトのうち１本はほぼ一致しますが、あとの２本は位置がずれてしまいます。　またクランクシャフトとの軸距も違いますね。
おそらくカブ110にWave125のエンジンを載せるのは、不可能とは言いませんが物理的に難しいと思います。　PGM-FIなので電気的な難しさもあります。

その他、ざっと目を通して気になったところを羅列します。

　・ヘッド、シリンダはWave125とぜんぜん違う。エキパイ取り付けのスタッドボルトがM8になっている。
　・ヘッドはFIカブ50に近い構成だが、それとも互換性はない。　ロッカーアームやカムも。
　・カムスプロケットは32T（14321-KWB-600）。　カムチェーンは90L（14401-KWB-601）。
　・カムシャフトはWave110iと同じ（14100-KWW-710）。　ただ点火やFIのセッティング、排気系の違いでWave110iと出力が異なる可能性はある。　ちなみにKWWはWave110iのこと。
　・シリンダのスタッドボルトは7mm。　Wave125は8mm。
　・オイルポンプは、Wave100と同様にカムチェーンガイドローラーから駆動。　ストローク55.5mmのWave110では、クランクから直接だった。
　・オイルポンプ内のローターはGF6なので、吐出量はWave100と同じ。
　・クランクベアリングはWave125と同じ63/22。　旧型は6304。
　・クラッチはWave125とも100とも互換性なし。　クラッチプレートやフリクションディスクもKWB（CZ-i110）で新規に起こされている。
　・プライマリードライブギヤー（23120-KTL-740）は、なぜかWave100と互換性あり。
　・ピストンピンは13mm。
　・セルモーターからの駆動はギヤドライブだが、Wave125とは違う。
　・ミッションギヤは旧型と互換性なし　Wave125と似ているけどちょっと違う。

などなど。

まとめますと、カブ110/Wave110iのエンジンは、Wave125とも、Wave100とも、FIカブ50とも違います。
強いて言えば、Wave125にFIカブ50の新技術を取り入れた、と言えなくもないですが、基本的に全く新しい系列のエンジンと考えるべきでしょう。　まさしく新時代のカブ用エンジンです。
プライマリードライブギヤーのように流用部品があるのは、単に「問題なく流用できるなら、その方が安いから」でしょう。

ところでプレスリリースには「二段クラッチ」と表現されていますが、単にC100EXと同様の二次側遠心クラッチのことです。　日本のカブ乗りは二次側遠心に馴染みがないので、四輪のツインツラッチと間違えている人も多いようですが、使い勝手は一次側遠心と変わりません。

いずれこのエンジンをベースにボアアップした、125cc超バージョンが発売されるのかもしれません。　ただシリンダのスタッドボルトが7mmなので、あまり排気量は大きくできないかも。
それと、基本的に上セルエンジンしか成立しなさそう。　下セル版は不可能でしょう。

ちなみに、1速 2.615、2速 1.555、3速 1.136、4速 0.916 という変速比は、これまでの自分の経験からすると「理想的」な変速比です（一次減速比は4.058で従来と同じ）。　特に1速が高いのがいいですね。

ところで、やはり気になるのはマレーシアのEX-5の今後です（しつこい？）。
現行EX-5もモナカフレームなんで、次期FMCではカブ110と同様にパイプフレームになるんでしょうね。　デザインはカウル次第でどうとでもなるので、フレームはカブ110と共通になるのかも。

だったら日本でも売ってくれないかなぁ。　カブ110はシングルシートの実用車、EX-5はダブルシートのスポーツ車（？）的な立ち位置で。